Den Grundstein für das Unternehmen Danone legten vor allem zwei Männer: Charles Gervais und Isaac Carasso.

1850 begann der Franzose Charles Gervais in der Normandie mit der Produktion von Frischkäse. Zunächst ganz unabhängig davon beschäftigte sich
1919 der Firmengründer von DANONE, Isaac Carasso, in Barcelona mit der Entwicklung einer Rezeptur für Joghurt, die Kindern bei Durchfallerkrankungen helfen sollte. Dieser Joghurt wurde in den ersten Jahren ausschließlich in Apotheken verkauft. Isaac Carasso benannte seine Joghurt-Linie nach seinem Sohn Daniel, für den er die Koseform „Danon“ gebrauchte.
1920 gründete das Unternehmen Charles Gervais mit einem Importgeschäft für Frischkäse seine erste deutsche Niederlassung in Köln.
1967 kam es auf internationaler Ebene zu einem Zusammenschluss der Unternehmen Gervais und DANONE.

1969, zwei Jahre später, resultierte daraus in Deutschland die Gründung der deutschen Gervais DANONE AG. Seit 1996 firmiert das Unternehmen als DANONE GmbH.
2007 kam es auf internationaler Ebene zu einer Übernahme des niederländischen Unternehmens Royal Numico, einem führenden Hersteller von Babynahrung sowie medizinischer Nahrung.

Mit dieser Erweiterung der Geschäftssektoren verstärkt die Danone Gruppe ihre Gesundheitspositionierung und unterstreicht ihre Philosophie, „Menschen in der ganzen Welt dabei unterstützen zu wollen, zu wachsen, besser zu leben und sich optimal zu entfalten, indem sie jeden Tag schmackhaftere, abwechslungsreichere und gesündere Lebensmittel zu sich nehmen.“

In den ersten Jahren wurde Danone Joghurt nur in Apotheken verkauft.